主要功能
可以看到M3R的界面是有GBA版本的M3改进而来。同样支持M3专用的MOONSHELL和PDA模式。PDA模式的版本为1.1简体中文版。
支持皮肤功能
要玩NDS和GBA游戏（GBA游戏需要扩展卡支持），要在TF上建立一个NDS和GBA文件夹。把相应的ROM拷贝进去即可。
如果你原来用的是其他烧录卡，如R4。现在要转到M3R的时候要注意以下几点。
1.M3R的NDS和NDS游戏存档是存储在NDS文件夹的。
2.存档是以.0 .1这样的结尾，这样做的方式是为了支持多个存档。如果你是R4的512K存档，直接改名就能使用。
3.如果你的存档不是512KB，请用转换器转换。
引导SLOT-2卡的时候可以选择引导GBA和NDS模式，如果你的G6这样的卡，就可以直接引导到G6的GBA模式，而不需要再进入G6的NDS模式后再进入GBA模式了。
支持SDHC标准，这意味着你可以使用4GB或者以上的存储卡
M3R的游戏载入机制有一定变化。主要体现在
1. 运行游戏前会提示你使用那些补丁，如游戏速度改变，软复位，金手指等。
2. 每个游戏都可以分别设置不同的补丁。
3. 软复位方法可以更换两种方式。
